Der Heider SV wurde am 14. Oktober 1925 im kleinen Saal des Tivoli von 29 Reservespielern des VfL Heide gegründet, die unzufrieden mit der Struktur und Vereinsführung waren.

Obwohl als reiner Fußballverein gegründet, taten sich in der langen Geschichte auch immer wieder andere Sparten hervor. So gab es von 1942 bis 1990 eine eigene Handballabteilung, es gab Damengymnastik und sogar Karate. Aktuell begleiten die Trimm-Gruppe, Rücken Fit und das Sportabzeichen den breiten Fußballapparat um Liga, Herren, Damen und Jugend, sowie Alt-Herren und Schiedsrichterwesen.

Als kleinste Stadt mit einem erstklassigen Verein machte man sich in der Blütezeit der 50er und 60er Jahre als “kleiner HSV” einen Namen, spielte gegen den Hamburger SV, Hannover 96, Werder Bremen oder den FC St. Pauli. Zuhause blieb Heide dabei immer gefürchtet, galt mit durchschnittlich 8.000 Zuschauern pro Heimspiel als echter Zuschauermagnet in der gesamten Region.

Im Zuge der immer stärker werdenden Professionalisierung im Fußball konnte der HSV nicht mehr oben mithalten, rutschte 1976 schließlich in die Viertklassigkeit ab. Anfang der 90er Jahre versuchte man mit kräftigen Investitionen den Weg zurück nach oben und scheiterte doch immer wieder in der entscheidenden Relegation.

Als 1997 der Aufstieg in die drittklassige Regionalliga gegen SV Arminia Hannover abermals nicht gelang, wandten sich große Sponsoren ab. Angesichts immenser finanzieller Probleme und akuter Existenzängste konnte man sich dennoch einige Spielzeiten lang sportlich über Wasser halten, ehe der Abstieg in die fünfte Liga 2004 nicht mehr zu verhindern war.

Mit einer neuen Kaderphilosophie und der Integration vieler Jugendtalente ließ sich der Club deutlich stabilisieren. In einem weiteren Schritt folgte 2014 die Ausgliederung der Ligamannschaft zur GmbH, an der der Verein 100 Prozent der Anteile hält.